Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CITED1Q99966 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CITED1Q99966 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CITED1Q99966 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CITED1Q99966 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CITED1Q99966 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CITED1Q99966 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CITED1Q99966 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED1Q99966 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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