Protein–RNA interactions for Protein: Q96S16

JMJD8, JmjC domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8Q96S16 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JMJD8Q96S16 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JMJD8Q96S16 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms