Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HHIPQ96QV1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HHIPQ96QV1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms