Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM20AQ96MK3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms