Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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SAMD8Q96LT4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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SAMD8Q96LT4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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SAMD8Q96LT4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
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SAMD8Q96LT4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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SAMD8Q96LT4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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SAMD8Q96LT4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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SAMD8Q96LT4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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