Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM47Q96LD4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms