Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MFSD3Q96ES6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MFSD3Q96ES6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MFSD3Q96ES6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MFSD3Q96ES6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MFSD3Q96ES6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MFSD3Q96ES6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MFSD3Q96ES6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MFSD3Q96ES6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MFSD3Q96ES6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MFSD3Q96ES6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MFSD3Q96ES6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MFSD3Q96ES6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms