Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4CQ96DT6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms