Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DHX58Q96C10 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms