Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3DQ96BQ1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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FAM3DQ96BQ1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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