Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms