Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERVK_113Q902F9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms