Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSPC1Q8WXF1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSPC1Q8WXF1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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