Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSMEM1Q8WWF3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms