Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEDD1Q8NHV4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEDD1Q8NHV4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms