Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC9Q8NEP7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms