Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC63Q8NA47 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms