Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC17Q8N6Y2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRC17Q8N6Y2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms