Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00612Q8N6U2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms