Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHCHD4Q8N4Q1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms