Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11FIP4Q86YS3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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