Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms