Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms