Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9AQ7Z3C6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms