Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN12Q6ZSI9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms