Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms