Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms