Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SUSD1Q6UWL2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms