Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP4Q6PIL6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms