Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF544Q6NX49 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms