Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40BQ6NWY9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms