Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102BQ68D86 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102BQ68D86 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms