Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ECM29Q5VYK3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms