Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CELF3Q5SZQ8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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