Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHYHD1Q5SRE7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms