Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NEXMIFQ5QGS0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEXMIFQ5QGS0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEXMIFQ5QGS0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEXMIFQ5QGS0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEXMIFQ5QGS0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEXMIFQ5QGS0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEXMIFQ5QGS0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NEXMIFQ5QGS0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEXMIFQ5QGS0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEXMIFQ5QGS0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEXMIFQ5QGS0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEXMIFQ5QGS0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NEXMIFQ5QGS0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEXMIFQ5QGS0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEXMIFQ5QGS0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEXMIFQ5QGS0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms