Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A3Q5K4L6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms