Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFTN2Q52LD8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN2Q52LD8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms