Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF212Q495C1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms