Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TBRG1Q3YBR2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms