Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB5Q2M3G0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB5Q2M3G0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms