Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNOP1Q1ED39 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KNOP1Q1ED39 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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