Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GEN1Q17RS7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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