Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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PDK4Q16654 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDK4Q16654 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PDK4Q16654 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PDK4Q16654 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PDK4Q16654 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PDK4Q16654 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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PDK4Q16654 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDK4Q16654 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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