Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STX1AQ16623 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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