Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDB1Q16531 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDB1Q16531 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms