Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN9AQ15858 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
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