Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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SYCP1Q15431 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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SYCP1Q15431 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP1Q15431 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
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SYCP1Q15431 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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SYCP1Q15431 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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SYCP1Q15431 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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SYCP1Q15431 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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SYCP1Q15431 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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SYCP1Q15431 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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