Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNB1Q14721 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNB1Q14721 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms