Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCD11Q14690 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCD11Q14690 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCD11Q14690 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCD11Q14690 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCD11Q14690 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCD11Q14690 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCD11Q14690 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD11Q14690 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCD11Q14690 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCD11Q14690 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCD11Q14690 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCD11Q14690 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCD11Q14690 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCD11Q14690 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCD11Q14690 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDCD11Q14690 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCD11Q14690 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCD11Q14690 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCD11Q14690 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDCD11Q14690 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCD11Q14690 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCD11Q14690 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCD11Q14690 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD11Q14690 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms